MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782204

Total Repeats: 1085

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014503	A	8	8	14	21	100 %	0 %	0 %	0 %	307149680
2	NC_014503	ATTT	2	8	71	78	25 %	75 %	0 %	0 %	307149680
3	NC_014503	TTC	3	9	133	141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149680
4	NC_014503	TGC	2	6	163	168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149680
5	NC_014503	T	6	6	181	186	0 %	100 %	0 %	0 %	307149680
6	NC_014503	ACA	2	6	187	192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149680
7	NC_014503	TAAA	2	8	201	208	75 %	25 %	0 %	0 %	307149680
8	NC_014503	TA	3	6	240	245	50 %	50 %	0 %	0 %	307149680
9	NC_014503	T	7	7	330	336	0 %	100 %	0 %	0 %	307149680
10	NC_014503	AGA	2	6	337	342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149680
11	NC_014503	ATT	2	6	357	362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149680
12	NC_014503	AGTC	2	8	406	413	25 %	25 %	25 %	25 %	307149680
13	NC_014503	ATTT	2	8	450	457	25 %	75 %	0 %	0 %	307149680
14	NC_014503	TATT	2	8	572	579	25 %	75 %	0 %	0 %	307149680
15	NC_014503	ATT	2	6	643	648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149680
16	NC_014503	GAG	2	6	731	736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149680
17	NC_014503	CTG	2	6	775	780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149681
18	NC_014503	AAGG	2	8	783	790	50 %	0 %	50 %	0 %	307149681
19	NC_014503	GTT	2	6	803	808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149681
20	NC_014503	ATG	3	9	814	822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149681
21	NC_014503	AGA	2	6	899	904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149681
22	NC_014503	A	6	6	917	922	100 %	0 %	0 %	0 %	307149681
23	NC_014503	A	7	7	946	952	100 %	0 %	0 %	0 %	307149681
24	NC_014503	ATTT	2	8	955	962	25 %	75 %	0 %	0 %	307149681
25	NC_014503	TATTT	2	10	975	984	20 %	80 %	0 %	0 %	307149681
26	NC_014503	GGT	2	6	1005	1010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307149681
27	NC_014503	TTA	2	6	1011	1016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149681
28	NC_014503	AAT	2	6	1029	1034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149681
29	NC_014503	ATT	2	6	1041	1046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149681
30	NC_014503	CGC	2	6	1066	1071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149681
31	NC_014503	TTG	2	6	1092	1097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149681
32	NC_014503	ATT	2	6	1099	1104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149681
33	NC_014503	TAT	2	6	1341	1346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149681
34	NC_014503	TAT	2	6	1353	1358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149681
35	NC_014503	AGTT	2	8	1388	1395	25 %	50 %	25 %	0 %	307149681
36	NC_014503	ACTC	2	8	1413	1420	25 %	25 %	0 %	50 %	307149681
37	NC_014503	CATT	2	8	1478	1485	25 %	50 %	0 %	25 %	307149681
38	NC_014503	TAT	2	6	1505	1510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149681
39	NC_014503	A	6	6	1550	1555	100 %	0 %	0 %	0 %	307149681
40	NC_014503	A	6	6	1775	1780	100 %	0 %	0 %	0 %	307149681
41	NC_014503	TAA	2	6	1892	1897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149681
42	NC_014503	TA	3	6	1905	1910	50 %	50 %	0 %	0 %	307149681
43	NC_014503	CGA	2	6	2013	2018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149681
44	NC_014503	AAC	2	6	2054	2059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149681
45	NC_014503	A	6	6	2068	2073	100 %	0 %	0 %	0 %	307149681
46	NC_014503	ATT	2	6	2082	2087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149681
47	NC_014503	A	6	6	2089	2094	100 %	0 %	0 %	0 %	307149681
48	NC_014503	ATTTTA	2	12	2101	2112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149681
49	NC_014503	GAG	2	6	2163	2168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149681
50	NC_014503	CTG	2	6	2212	2217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149681
51	NC_014503	TCA	2	6	2249	2254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149681
52	NC_014503	GAC	2	6	2255	2260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149681
53	NC_014503	T	6	6	2294	2299	0 %	100 %	0 %	0 %	307149681
54	NC_014503	GA	3	6	2375	2380	50 %	0 %	50 %	0 %	307149681
55	NC_014503	TCA	2	6	2423	2428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149681
56	NC_014503	TTA	2	6	2451	2456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149681
57	NC_014503	ATTAT	2	10	2513	2522	40 %	60 %	0 %	0 %	307149681
58	NC_014503	ATT	2	6	2532	2537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149681
59	NC_014503	G	6	6	2597	2602	0 %	0 %	100 %	0 %	307149681
60	NC_014503	TAA	2	6	2648	2653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149681
61	NC_014503	ATT	2	6	2672	2677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149681
62	NC_014503	GAA	2	6	2718	2723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149681
63	NC_014503	ATA	2	6	2806	2811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149681
64	NC_014503	TAA	2	6	2858	2863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149681
65	NC_014503	TAG	2	6	2894	2899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149681
66	NC_014503	CGC	2	6	3028	3033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149681
67	NC_014503	GTTC	2	8	3045	3052	0 %	50 %	25 %	25 %	307149681
68	NC_014503	AAG	2	6	3072	3077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149681
69	NC_014503	TTG	2	6	3114	3119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149681
70	NC_014503	A	6	6	3123	3128	100 %	0 %	0 %	0 %	307149681
71	NC_014503	ACC	2	6	3146	3151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149681
72	NC_014503	ATTT	2	8	3152	3159	25 %	75 %	0 %	0 %	307149681
73	NC_014503	GTT	2	6	3173	3178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149681
74	NC_014503	GTGG	2	8	3197	3204	0 %	25 %	75 %	0 %	307149681
75	NC_014503	ATG	2	6	3217	3222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149681
76	NC_014503	ATT	2	6	3258	3263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149682
77	NC_014503	TCT	2	6	3266	3271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149682
78	NC_014503	TA	3	6	3298	3303	50 %	50 %	0 %	0 %	307149682
79	NC_014503	AGAA	2	8	3317	3324	75 %	0 %	25 %	0 %	307149682
80	NC_014503	A	6	6	3340	3345	100 %	0 %	0 %	0 %	307149682
81	NC_014503	A	6	6	3374	3379	100 %	0 %	0 %	0 %	307149682
82	NC_014503	TGA	2	6	3435	3440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149682
83	NC_014503	ACG	2	6	3476	3481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149682
84	NC_014503	GA	3	6	3540	3545	50 %	0 %	50 %	0 %	307149682
85	NC_014503	ATC	2	6	3563	3568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149682
86	NC_014503	GATT	2	8	3573	3580	25 %	50 %	25 %	0 %	307149682
87	NC_014503	TAA	2	6	3581	3586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149682
88	NC_014503	A	8	8	3599	3606	100 %	0 %	0 %	0 %	307149682
89	NC_014503	T	6	6	3616	3621	0 %	100 %	0 %	0 %	307149682
90	NC_014503	TAA	2	6	3633	3638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149682
91	NC_014503	GTC	2	6	3689	3694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149682
92	NC_014503	ATT	2	6	3724	3729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149682
93	NC_014503	A	7	7	3756	3762	100 %	0 %	0 %	0 %	307149682
94	NC_014503	A	7	7	3768	3774	100 %	0 %	0 %	0 %	307149682
95	NC_014503	TTA	2	6	3829	3834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149682
96	NC_014503	ATTTTT	2	12	3844	3855	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307149682
97	NC_014503	TCA	3	9	3860	3868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149682
98	NC_014503	TATCAA	2	12	3895	3906	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307149682
99	NC_014503	AGA	2	6	3909	3914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149682
100	NC_014503	TCCA	2	8	3961	3968	25 %	25 %	0 %	50 %	307149682
101	NC_014503	TTAA	2	8	3982	3989	50 %	50 %	0 %	0 %	307149682
102	NC_014503	T	6	6	3996	4001	0 %	100 %	0 %	0 %	307149682
103	NC_014503	GAA	2	6	4027	4032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149682
104	NC_014503	GCC	2	6	4104	4109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149682
105	NC_014503	AGA	2	6	4113	4118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149682
106	NC_014503	GAA	2	6	4171	4176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149682
107	NC_014503	AGTT	2	8	4196	4203	25 %	50 %	25 %	0 %	307149682
108	NC_014503	A	6	6	4300	4305	100 %	0 %	0 %	0 %	307149682
109	NC_014503	A	6	6	4353	4358	100 %	0 %	0 %	0 %	307149682
110	NC_014503	T	6	6	4414	4419	0 %	100 %	0 %	0 %	307149682
111	NC_014503	GAA	2	6	4420	4425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149682
112	NC_014503	TTAT	2	8	4426	4433	25 %	75 %	0 %	0 %	307149682
113	NC_014503	CAG	2	6	4484	4489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149682
114	NC_014503	GCG	2	6	4502	4507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149682
115	NC_014503	CTAAG	2	10	4591	4600	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_014503	TTAA	2	8	4624	4631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014503	TAA	2	6	4651	4656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149683
118	NC_014503	A	6	6	4655	4660	100 %	0 %	0 %	0 %	307149683
119	NC_014503	AGG	4	12	4792	4803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149683
120	NC_014503	G	6	6	4852	4857	0 %	0 %	100 %	0 %	307149683
121	NC_014503	GGC	2	6	4861	4866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149683
122	NC_014503	AACGG	2	10	4939	4948	40 %	0 %	40 %	20 %	307149683
123	NC_014503	AAT	2	6	4982	4987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149683
124	NC_014503	CGG	2	6	5043	5048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149683
125	NC_014503	T	6	6	5054	5059	0 %	100 %	0 %	0 %	307149683
126	NC_014503	AAG	2	6	5070	5075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149683
127	NC_014503	TAT	2	6	5105	5110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149683
128	NC_014503	AAT	2	6	5111	5116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149683
129	NC_014503	A	6	6	5132	5137	100 %	0 %	0 %	0 %	307149683
130	NC_014503	ATA	2	6	5172	5177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149683
131	NC_014503	G	6	6	5205	5210	0 %	0 %	100 %	0 %	307149683
132	NC_014503	TCAA	2	8	5232	5239	50 %	25 %	0 %	25 %	307149683
133	NC_014503	G	7	7	5243	5249	0 %	0 %	100 %	0 %	307149683
134	NC_014503	TTG	2	6	5261	5266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149683
135	NC_014503	ATG	2	6	5283	5288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149683
136	NC_014503	CAA	2	6	5321	5326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149683
137	NC_014503	GAT	2	6	5336	5341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149683
138	NC_014503	GGC	2	6	5386	5391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149683
139	NC_014503	CT	3	6	5449	5454	0 %	50 %	0 %	50 %	307149683
140	NC_014503	T	7	7	5467	5473	0 %	100 %	0 %	0 %	307149683
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143	NC_014503	ATT	3	9	5549	5557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149683
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160	NC_014503	T	7	7	6193	6199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_014503	CAAGAA	2	12	6209	6220	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	307149684
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274	NC_014503	TGA	2	6	11070	11075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
275	NC_014503	ATT	2	6	11088	11093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_014503	ATT	2	6	11103	11108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_014503	TGA	2	6	11149	11154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
279	NC_014503	GAT	2	6	11224	11229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_014503	ATAA	2	8	11289	11296	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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418	NC_014503	CTTC	2	8	17689	17696	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
419	NC_014503	CTC	2	6	17797	17802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
420	NC_014503	ACT	2	6	17902	17907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
421	NC_014503	TAA	2	6	18010	18015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_014503	T	6	6	18091	18096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
423	NC_014503	A	6	6	18150	18155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
424	NC_014503	CATC	2	8	18219	18226	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
425	NC_014503	AAT	2	6	18288	18293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
426	NC_014503	GAA	2	6	18350	18355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
427	NC_014503	TAAAA	2	10	18367	18376	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
428	NC_014503	CT	3	6	18403	18408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
429	NC_014503	TTG	2	6	18503	18508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
430	NC_014503	GTT	2	6	18583	18588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
431	NC_014503	T	8	8	18694	18701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_014503	ACT	2	6	18765	18770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
433	NC_014503	CAT	2	6	18818	18823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
434	NC_014503	ACG	2	6	18872	18877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
435	NC_014503	GTCA	2	8	18887	18894	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
436	NC_014503	GTC	2	6	18910	18915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
437	NC_014503	AGA	2	6	18935	18940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
438	NC_014503	CGTGG	2	10	19000	19009	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
439	NC_014503	ACT	2	6	19037	19042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
440	NC_014503	T	6	6	19100	19105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_014503	T	6	6	19163	19168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_014503	GT	3	6	19207	19212	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
443	NC_014503	TGC	2	6	19250	19255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
444	NC_014503	T	7	7	19286	19292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_014503	T	6	6	19349	19354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_014503	TTC	2	6	19394	19399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
447	NC_014503	ATAA	2	8	19411	19418	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_014503	ATT	2	6	19439	19444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_014503	TCA	2	6	19478	19483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
450	NC_014503	CTT	2	6	19493	19498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
451	NC_014503	TGA	2	6	19509	19514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
452	NC_014503	TAA	2	6	19526	19531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_014503	AATT	2	8	19532	19539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_014503	TAA	2	6	19605	19610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_014503	T	6	6	19619	19624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_014503	TAA	2	6	19635	19640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_014503	TAA	2	6	19664	19669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_014503	ATT	2	6	19726	19731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_014503	CGT	2	6	19739	19744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
460	NC_014503	TA	3	6	19760	19765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_014503	T	6	6	19917	19922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_014503	ATA	2	6	20031	20036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_014503	TTC	2	6	20160	20165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
464	NC_014503	GTA	2	6	20186	20191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
465	NC_014503	TGGT	2	8	20265	20272	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
466	NC_014503	TCG	2	6	20412	20417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
467	NC_014503	GAG	2	6	20423	20428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
468	NC_014503	TCAA	2	8	20443	20450	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
469	NC_014503	GGA	2	6	20540	20545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
470	NC_014503	CTT	2	6	20562	20567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
471	NC_014503	GTC	2	6	20607	20612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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473	NC_014503	TGAT	2	8	20686	20693	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
474	NC_014503	ATA	2	6	20711	20716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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476	NC_014503	A	8	8	20900	20907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
477	NC_014503	GAAA	2	8	20922	20929	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_014503	AATT	2	8	21232	21239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_014503	TA	3	6	21306	21311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_014503	GAA	2	6	21317	21322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
484	NC_014503	T	7	7	21331	21337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_014503	ACA	2	6	21349	21354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
486	NC_014503	TTAA	2	8	21388	21395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_014503	CCG	2	6	22124	22129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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